鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室是以鄱阳湖及其流域为研究对象，围绕湖泊生态环境保护与资源利用领域重大科学与技术问题开展理论和技术研究的综合创新平台。
鄱阳湖是我国第一大淡水湖，保持着通江、浅水、草型和壅塞型的湖泊自然特征，在调洪蓄水、调节气候、降解污染、维护生物多样性等方面发挥重要生态功能，是长江流域生物多样性最丰富的湖泊，保护鄱阳湖生态环境对维持长江中下游生态安全极为重要。深入研究鄱阳湖自然特征、演变规律、保护管理对策是生态文明建设的基本要求，对推动湖泊科学、湿地科学、自然资源管理与利用具有重要意义。
南昌大学以服务国家和区域发展为已任，整合环境科学、生态学、生物学、水文水资源学、管理科学、水利工程等多个学科，组建研究平台，围绕鄱阳湖这一特色资源，以水安全为主线，从水资源、水环境、水生态、水管理等方面开展多学科交叉研究，为鄱阳湖生态环境保护和地方社会经济发展做出了重要贡献。
2003年，成立南昌大学鄱阳湖研究中心，并获批江西省鄱阳湖综合治理与资源利用省级重点实验室；2004年，实验室成为省部共建的教育部重点实验室；2007年，实验室通过建设验收，正式成为教育部重点实验室；2015年，实验室以“良好”通过第一次教育部评估；2015-2019年，以实验室为主体建立的江西省水安全协同创新中心通过省级验收，并根据发展需要与江西省发展改革委员会共建成立“江西省生态文明研究院”；2020年，实验室获批国家林业和草原局“江西鄱阳湖湿地保护与恢复国家长期科研基地”。
